2011年4月16日，阿梅利尔正式宣布建立政治实体组织“邦萨摩洛伊斯兰运动”（Bangsamoro Islamic Movement），并将邦萨摩洛伊斯兰自由战士作为其附属的军事组织；作为回应，摩伊解也宣布阿梅利尔必须为自己的行为负责，而且摩伊解已难以忍受他的这种行为，这也预示着双方彻底分道扬镳。但是，邦萨摩洛伊斯兰自由战士对于继续坚持建立独立的伊斯兰国家的立场有所缓和。
此后，邦萨摩洛伊斯兰自由战士的袭击目标还包括政府当局、警察局、摩伊解目标等，也像阿布沙耶夫那样实施绑架。其活动范围主要是棉兰老岛的马京达瑙省。
协议签订后，摩伊解第105基地的司令阿梅利尔（Ameril Umbra Kato）在2010年7月辞去摩伊解的职务，并带领数百名摩伊解成员建立了邦萨摩洛伊斯兰自由战士。成立之初的几个月，由于力量弱小和为了逃避政府打击等原因，该组织处于秘密状态；到了同年12月，该组织的活动才曝光。
此后，邦萨摩洛伊斯兰自由战士认为，摩伊解并没有遵循伊斯兰的原则，来推动摩洛穆斯林的解放。双方领导人在建国理念和斗争方式等方面的分歧，直接导致双方的分裂。
2011年初，他宣称成立邦萨摩洛伊斯兰自由战士的直接目的，就是为了将“邦萨摩洛民众从菲律宾政府手中解放出来，无论政府同意与否，我们都会在我们所在的地区引入伊斯兰体系”，并且借用伊斯兰的话语，声称在棉兰老岛的战斗是“真正的圣战，真正的革命”。
2014年8月15日，邦萨摩洛伊斯兰自由战士宣布效忠在叙利亚和伊拉克活动的宗教极端武装“伊拉克和黎凡特伊斯兰国”（即后来的极端组织伊斯兰国），彻底成了宗教极端组织。
经过与菲政府数年的冲突和谈判，摩解与马可斯政府于1978年达成和平协议。摩解中的一小部分人（大约2900人）反对该协议，继续谋求摩洛地区的彻底独立。他们从摩解中分裂出来，成立了新的民族分离组织“摩洛伊斯兰解放阵线”（Moro Islamic Liberation Fronts，简称摩伊解）。
邦萨摩洛伊斯兰自由战士的领导人阿梅利尔属于摩伊解中的海归派。他毕业于沙特阿拉伯的伊玛目穆罕默德·本·沙特伊斯兰大学（Imam Muhammad bin Saud Islamic University），深受保守的瓦哈比教义所影响。因此，在政治理念和建国目标等问题上，与摩伊解领导人之间产生冲突在所难免。
2012年10月7日，摩伊解与菲律宾政府就在2016年成立棉兰老穆斯林自治区达成框架性协议，但是邦萨摩洛伊斯兰自由战士的发言人阿布（Abu Misri Mama）宣称采取观望态度，并表示“如果该协议最终流产了，我们还会继续坚持棉兰老的独立”。
邦萨摩洛伊斯兰自由战士成立后，与摩伊解之间的分歧公开化。双方的分道扬镳经历了一个过程。首先是在2011年1月底到2月初，邦萨摩洛伊斯兰自由战士与摩伊解在棉兰老岛地区，爆发了一系列的军事冲突，造成20多人死亡。
在经过10多年的斗争后，摩伊解在1992年与菲律宾拉莫斯政府签订和平协议，政府同意在棉兰老岛地区设立世俗的穆斯林自治区，不仅给予摩洛穆斯林较大的自治权利，摩伊解的领导人还担任棉兰老自治政府的要职，将他们吸纳进入国家机构中。
经过2017年的马拉维战事，菲南的宗教极端组织邦萨摩洛伊斯兰自由战、阿布沙耶夫、马乌德组织（Maute group）等的力量被大幅度削弱，活动范围也被大大压缩，它们在棉兰老岛的一些据点已经被菲律宾政府攻破。
作者是云南大学周边外交研究中心国际关系研究院助理研究员、西北政法大学反恐怖主义研究院特约研究员
2011年11月20日，邦萨摩洛伊斯兰自由战士一个地方领导人美特恩（Meten Gulapal）与摩伊解在棉兰老岛108号基地附近的交火中身亡；11月27日，摩伊解的高级领导人宣布，阿梅利尔在马京达瑙省托里尔（Toril）地区被打死。
邦萨摩伊自由战士的由来
经过2017年的马拉维战事，菲南的宗教极端组织邦萨摩洛伊斯兰自由战、阿布沙耶夫、马乌德组织（Maute group）等的力量被大幅度削弱，活动范围也被大大压缩，它们在棉兰老岛的一些据点，已经被菲律宾政府攻破。
邦萨摩洛伊斯兰自由战士成立后，除了将摩伊解作为对手，还把普通民众作为袭击的目标。2011年2月6日，邦萨摩洛伊斯兰自由战士在棉兰老岛的北哥达巴托省（North Catabato）的敦观村（Dunguan）发动了一次恐怖袭击，造成两名村民死亡。这是其从摩伊解中分裂出来后，首次发动针对平民的恐怖袭击。
邦萨摩洛伊斯兰自由战士是菲南民族分离组织中的极端派别，它的成立源于菲南民族分离组织的多次分裂。菲律宾在1946年7月4日取得独立后，继续采取西班牙和美国殖民者对棉兰老岛地区的强制同化政策，激化了与当地摩洛穆斯林之间的民族冲突及宗教对立。
2021年5月8日，约100余名来自“邦萨摩洛伊斯兰自由战士”（Bangsamoro Islamic Freedom Fighters，简称BIFF）的武装分子，试图效仿2017年马拉维战事中“攻城略地”的方式，占领菲律宾棉兰老岛马京达瑙省的达图·帕格拉斯镇（Datu Paglas）的镇中心。这是继2020年8月24日阿布沙耶夫在苏禄省和乐市发动两起恐怖袭击后的最新袭击。
其次，不断的口水战。2011年4月1日，摩伊解领导层发表声明，宣布阿梅利尔因为建立了邦萨摩洛伊斯兰自由战士，违反了摩伊解的政策，所以被开除出摩伊解。
2014年1月25日，阿布在一个媒体中宣布，许多摩伊解的基层领导因为反对与菲律宾政府的和平谈判，而准备加入邦萨摩洛伊斯兰自由战士；两天后，他还认为这些人加入该组织，是因为它是摩洛民众“唯一的革命组织”。
邦萨摩伊自由战士的宗教极端化
1972年9月，马可斯政府宣布军事管制法，对棉兰老岛地区发动全面战争，摩洛穆斯林将原有的民兵组织联合起来，成立以“摩洛民族解放阵线”（Moro National Liberation Front，简称摩解）为代表的民族分离组织，目标是在菲南建立独立的伊斯兰国家。摩解成立后得到同为伊斯兰国家的利比亚、马来西亚等国的支持。
冠状病毒疫情暴发后，菲律宾政府对棉兰老岛多个地区实施严格的隔离措施，使包括邦萨摩洛伊斯兰自由战士在内的诸多宗教极端组织日常活动受到严重影响。在这种情况下，这些宗教极端组织铤而走险发动恐怖袭击，也有针对菲律宾政府疫情管控措施的因素。
邦萨摩洛伊斯兰自由战士的建立，与菲律宾政府同摩伊解在2008年7月27日、2009年12月、2010年2月12日先后三次在马来西亚等地进行三次谈判有关。谈判的最终结果是摩伊解和菲律宾政府达成和平协议，该协议最为重要的内容，是在棉兰老岛地区建立一个以穆斯林为主体的“次国家”（Sub-state）自治区，而不是完全独立的伊斯兰国家。
邦萨摩洛伊斯兰自由战士的成立，吸引了摩伊解内部一些激进和极端分子加入。2011年9月18日，摩伊解发言人称，前摩伊解特别行动小组（Special Operation Group）的领导人——来自印度尼西亚的爆炸专家阿卜杜拉巴斯特（Abdulbasit Usman）加入了邦萨摩洛伊斯兰自由战士。
