实验室会从新加坡中央医院或国立大学医院的结核病实验室收到结核菌基因组DNA,把它分成可阅读的短片段进行排序,再通过生物信息分析查出DNA特征,整个过程耗时七天至12天。
黄熙玲说,用全基因组排序辅助结核病例的追踪工作是相对较新的方法,在全国层面进行结核菌样本全基因组排序的国家不多。
本地冠病病例的病毒样本也会送去做全基因组排序。黄熙玲说,如果是冠病,追踪接触者的工作人员通常已经知道病患接触过谁,再用全基因组排序佐证。
结核病在本地未完全消除,去年的新增病例大致上持平,国家传染病中心最近开始利用全基因组排序更准确地找出感染群,以控制病菌传播。
然而,结核病的潜伏期很长,可以长达好几年,病患发病时通常记不得接触过谁,因此工作人员得先看病菌基因组是否有相似之处,才去访问有关病患。
反之,全基因组排序能把感染群的范围缩小,追踪接触者的工作人员就能更快、更准确地找到感染群。
国家传染病中心国家结核病项目副主任黄熙玲医生前天受访时说:“MIRU是另一种排序方法,只能辨识基因组的一小部分,针对性相当低,找到的感染群范围很大,病例之间也没有明显关联。”
结核病发生率大致上不变,去年每10万名本地居民有33.9人患病,前年则为34.7人。
之前分析法针对性较低 所找到感染群范围很大
国家传染病中心前天邀请媒体到国家公共卫生实验室参观,并讲解全基因组排序如何运作。
在使用全基因组排序之前,当局是用分子分型法如简称为MIRU-VNTR的分析法为样本分型。
年长者与男性较容易患病,去年约七成病例为年满50岁者,约65%为男性。
全基因组排序能把结核病感染群的范围缩小,追踪接触者的工作人员就能更快、更准确地找到感染群。国家传染病中心至今利用这个方法找到三个感染群,分别为去年10月公布的后港1巷第174D座租赁组屋感染群,以及今年1月公布的两个勿洛投注中心感染群。
国家传染病中心至今利用这个方法找到三个结核病感染群,分别为去年10月公布的后港1巷第174D座租赁组屋感染群,以及今年1月公布的两个勿洛投注中心感染群。
去年11月,国家公共卫生实验室开始为所有测出有结核菌样本的基因组脱氧核糖核酸(DNA)进行全基因组排序,以辨识它们是否有同个感染源。实验室是在前年底开始为部分样本排序,随后逐步接收更多样本。
前天是世界防治结核病日,根据卫生部发布的最新数据,去年本地居民中新增1370起结核病例,比前年略少12人,其中近八成病例在新加坡出生。