印尼总统普拉博沃回应说：“我们希望与日本保持密切关系，以便为营造缓解大国间紧张局势的氛围作出贡献。”
普拉博沃与石破在记者会上承诺，将共同推进资源基础设施合作，通过多元路径实现脱碳。他们也确认将振兴人文交流以及人力资源方面的合作。
石破与普拉博沃同样是在2024年10月上任，并都曾出任防长。石破此次出访印尼的重点之一是与对方协议加强安全合作。他宣布，日本将通过为援助发展中国家的“海外安全援助计划”，为印尼提供两艘高速巡逻艇，帮助印尼加强海防能力。
在印度尼西亚访问的日本首相石破茂宣布总额1290亿日元（约11.2亿新元）的一揽子项目支持印尼发展，其中包括以贷款方式，支持扩充西爪哇港口。日印双方也协议于今年召开外长和防长的“2+2”会议，加强两国在安全和能源等领域的合作。
普拉博沃重视经济发展，上任后积极招商引资，并呼吁日企继续扩大在印尼的投资。
分析认为，日本寻求与东南亚国家建立更广泛的安全联盟，是为了应对频繁的中国海洋活动。
据报道，日本2017年为该海港扩建工程提供了1890亿日元的贷款，新一轮贷款的利率设在零到3%。日方重视这个扩建工程，因为海港周围有不少日本汽车制造业。港口扩建后，在印尼生产的日系汽车出口量预计能提高到每年60万辆，是目前的1.5倍。
继访问马来西亚后，石破星期六（1月11日）在雅加达与印度尼西亚总统普拉博沃举行约两小时的会谈。他在会议上说：“印尼位于印度洋和太平洋交汇的战略要地，我希望通过这次访问提升与印尼的全面战略伙伴关系，加强与印尼在国际问题上的合作。”
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不过，在所公布的日印合作项目中，仍以经济项目为多。峰会结束后，日本外交部宣布，将提供约70亿日元贷款支持印尼行政官员的培训，以及830亿日元的额外贷款，用于雅加达附近、巴丁班港的第三期扩建资金。
石破在联合记者会上指出，从地区和全球形势来看，近年的安全环境愈加严峻。世界上任何地方都不能容忍任何试图通过武力或胁迫、单方面改变现状的行为。
