台湾《镜周刊》5月7日报道，蔡英文已决定520卸任前特赦陈水扁，并由幕僚单位启动特赦作业。台湾总统府发言人林聿禅当时回应此事时说，总统府现阶段的立场仍是，“希望确保陈前总统获得妥善的健康照顾，并依照相关的法律规范办理”。
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综合ETtoday新闻云和中央社报道，柯文哲星期五（5月17日）上午赴民众党团参与党团会议，会后接受媒体访问。
柯文哲直言，以陈水扁保外就医的状态继续下去，不是一个健康的方法，“所以我觉得这样，也不是说叫特赦，正确讲法就是这个事件要做一个妥善的解决，这样拖下去不是一个民主国家该有的政策”。
不过，林聿禅星期四（5月16日）再次回应此事时说，“实际上相关程序都必须依法进行，并且也无此决定”，明确否认会特赦陈水扁。
谈及特赦陈水扁一事，柯文哲说，他一周前就讲过，这种重大事件应该总统自己出来说明，不应透过媒体放话测风向，结果今天变成这种局面，甚至有阴谋论指前后任总统互相推卸责任，“整个事件到最后变成是耍人家”。
台湾总统蔡英文据报将在卸任前特赦涉贪的前总统陈水扁后，台湾总统府明确否认会特赦陈水扁。民众党主席柯文哲对此表示，这种重大事件应该总统自己出来说明，不应透过媒体放话测风向，“整个事件到最后变成是耍人家”。
