柯文哲说，更重要的是，关于渔权的问题，台湾跟大陆最好能够坐下来谈，建立一套规则，避免这种事情再度发生。
另外，台湾民众党主席柯文哲上午出席民众党新春开工团拜会时谈到大陆渔船翻覆一事。他说，就台湾方面来讲，保护渔民权益、保护疆界，是政府该做的事情，当然驱离过程还是要尽量平和，造成伤亡还是要表达哀悼。
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中国大陆福建一艘渔船星期三下午进入金门县海域捕捞，被台湾海巡队船只追赶而翻覆，导致船上四人落海，其中两人送医抢救不治。大陆国台办表达强烈谴责，并要求台湾方面立即查明事件真相。台湾海洋委员会海巡署说明指出，大陆快艇越界捕鱼拒检，双方追逐时不慎翻覆酿成意外，已报请金门地方检察署调查。
对于大陆渔船在金门翻覆致两人死亡事件，台湾陆委会主委邱太三称与对岸保持联系，有调查结果会通知对方。
综合中天新闻网和中时新闻网报道，邱太三星期四（2月15日）说，陆委会、海巡署和对岸都保持一定程度的联系，目前整起案件已经移交检调进行调查，相关的资讯都报请检察官指挥侦办，有结果之后一定会通知对方。