两岸目前仅有四个航点，架次少、成本高，在野党和台商，多次呼吁政府，尽速恢复小三通未果。
总统府发言人张惇涵表示，行政院宣布的金马地区民众春节交通专案，是在兼顾离岛防疫周全的前提下，让在大陆生活、工作的金马民众和配偶能够透过小三通往返过年，满足人道的需求，“循序渐进恢复小三通，并期盼透过此次春节专案，作为疫后两岸人民之间健康有序交流的起点”。
国民党的金门立委陈玉珍在脸书表示，台北跟厦门可以直航，为何飞机可飞，金门人民就无法坐船往返厦门？她对上述这个迟来的好消息，觉得门开的不够大、不够快，但中央在春节前能开放让金马人民在春节前后透过小三通进出，也算是一份冬至团圆礼。
行政院会星期四终于拍板决定两岸重启小三通的春节方案，自明年1月7日起至2月6日实施。不过，对象仅限金门和马祖的民众民众及大陆配偶，不包括在大陆的台商和台生等。
小三通将自明年1月7日起至2月6日实施，但是对象仅限金门和马祖民众及大陆配偶，并以专案申请的方式，向交通部航港局提出申请。
但国民党前立委曹尔忠和陈清宝坚持要求蔡政府恢复完整的小三通，将在星期六（12月24日）发起“还我小三通”大游行。
两岸小三通，自2020年2月10日起，被台湾以防疫优先为由暂停迄今。
中央流行疫情指挥中心王必胜在星期四例行记者会中表示，因小三通专案返台者人数不多，不需要启动特别检疫措施。
循序渐进恢复小三通，并期盼透过此次春节专案，作为疫后两岸人民之间健康有序交流的起点。
——台湾总统府发言人
金门每天最多一班，马祖每周最多两班。2月6日后将视中国大陆疫情作滚动式检讨。
苏贞昌曾警告对大陆开放 恐造成抢药与防疫破口
王必胜：小三通专案 返台人数不多无需特别检疫
台湾的大陆委员会称，对岸小三通的海关、检验检疫等相关人员都已撤离。但国民党立委陈雪生联络福建省台办，称相关人员都在岗位上。
台湾行政院会星期四决定，重启两岸小三通的春节方案。
农历春节将至，大陆疫情因刚解封正快速升温中。面对民间对小三通的期盼，行政院长苏贞昌此前在12日警告，若此时轻率对大陆开放，恐造成大陆人来台抢药及台湾防疫破口。国安会秘书长顾立雄15日则在立法院证实，陆委会综合评估结果在农历年前会有结论，出现政府不同调的情况。
王必胜并指出，目前除了班纳杜（台湾称普拿疼）之外，大量异常购买的现象已扩大到其他同成分的乙醯胺酚（Acetaminophen）药品，若状况恶化，未来不排除比照用暂时性的实名制来管制购买。
