常见的不良反应包括注射部位肿痛、晕眩、发烧、肌肉酸痛、头痛，以及呼吸短促等。最常见的严重不良反应包括严重过敏性反应，所有患者都已在接受治疗后康复。

其他严重不良反应还包括呼吸困难、心跳加快、血压上升或下降、胸口不适和疼痛、晕厥、四肢麻痹或疼痛、视力变化、肝酶水平升高、关节疼痛、癫痫、耳鸣和发炎。大多数出现这些症状的患者都已康复或是正在康复中。另外，当局也接获45起贝尔氏麻痹症（俗称面瘫）的不良反应报告，大多数患者的情况并不严重。

本地有六人在接种第二剂冠病疫苗后出现心肌炎和心包炎。卫生部冠病疫苗专家团建议，年轻男性接种第二剂信使核糖核酸（mRNA）疫苗之后的一个星期，应避免剧烈的体力活动；在这段期间如果出现胸痛、气喘或者心跳异常的情况，也应该及时就医。

从去年12月30日至今年5月23日，卫生科学局共接获4704起疑似接种冠病疫苗导致的不良反应报告，占注射总剂量的0.13%；当中有157起属严重不良反应，占注射总剂量的0.004%。

这些对疫苗出现不良反应的病患中，有68%的年龄低于60岁，女性占了64%。